Então, se o universo não for eterno, um dia tudo o que conhecemos desaparecerá?‎

Certamente que sim. Pois o Universo é tudo o que existe. Então o fim do Universo é o desaparecimento total de tudo o que existe. Inclusive do tempo e do espaço, mesmo vazio. Antes do surgimento do Universo era assim, Não existia conteúdo nenhum, nem passagem de tempo, nem espaço, sequer vazio. Nem mesmo "antes" existia. Nem "o nada", pois não existia nada. E assim poderá vir a ser, com o fim do Universo, se tal ocorrer. E pode.