Já que ser é um ente que existe, o Universo seria então um ser? Se sim, isto não seria incoerente, já que o Universo não apresenta sensciência, volição, emoção e outros atributos?

Não. Um ser nem precisa ser vivo. Uma pedra é um ser. Um ente é tudo que possa ser concebido que possa existir, mesmo que não exista, Mas não como uma qualidade, um valor, um sentimento, uma categoria. Algo que seja ele em si mesmo e não um atributo de outro. Por exemplo, um corpo, uma coisa, um objeto, um indivíduo, uma instituição. O ente pode ser concreto (ou substancial), quando seria feito de algum componente sensorialmente perceptível, ou abstrato, se apenas concebido como uma ideia. Números e figuras geométricas são entes abstratos, bem como instituições, como um time de futebol. Um ser é um ente que seja concreto e, de fato, objetivamente, existe no mundo, fora das mentes. Os entes abstratos que, de fato, existam, são ditos "entidades". Espíritos, se existissem, seriam seres. Uma nação é uma entidade. O Universo é um ser concreto. Note que espíritos, se existissem, seriam concretos e não abstrações apenas. Concreto, filosoficamente, não significa ser material. Da mesma forma que nem todo ser físico é material. Um campo elétrico e um raio de luz são seres físicos não materiais.