o universo tem lógica?

Formalmente não. O comportamento da natureza não dá a menor bola para o que se esperaria, logicamente, que fosse. Então é preciso mudar a lógica para se adequar a ele. Quando a ciência descobre uma "lei" observada pelos fenômenos naturais, não se pode dizer que a natureza "obedece" tal lei. As leis naturais não são prescritivas, são descritivas. Se se observar uma ocorrência natural em desacordo com alguma lei, então a lei é que tem que ser mudada e não se dizer que a natureza está agindo de forma errada.