Professor, no ensino médio, sobre números quânticos, me diziam que veria a origem matemática deles na universidade. Agora, tendo química geral na faculdade, a professora diz que a matemática da equação de Schrödinger é muito avançada para entendermos. Devo apenas "aceitar" a teoria?

Não. Você pode, perfeitamente, cursar Estrutura da Matéria, Física Moderna ou Física Quântica do Curso de Física e entender os fundamentos e as soluções da Equação de Schrödinger. Você precisará de cursar até o Cálculo IV para resolver as equações, mas isso vale a pena, mesmo que não seja uma exigência do Curso de Química.