Como responder àqueles que dizem que assim como a teoria de newton, que era tida como verdade absoluta, foi superada por einstein, toda a ciencia será superada no futuro?

Não necessariamente toda, mas sempre é possível que conhecimentos científicos sejam revisados. Aliás, essa é uma das melhores características da ciência: nunca ser definitiva. Todo conhecimento científico é provisório, até que seja corrigido. Pode ser que já seja definitivo, mas nunca se sabe. Verdades absolutas, simplesmente, não existem.