Isso significa que não sabemos quais são os blocos de construção do Universo? Poderá o Universo ser informação pura situada numa matriz bidimensional?‎

Não acho que possa não. O Universo é constituído de conteúdo verdadeiramente substancial, isto é, matéria, radiação e campo. Por outro lado, qualquer informação só existe se estiver assinalada em uma base física. Não há informação sem meio físico que a suporte. Não precisa ser material, mas tem que ser físico. Pode estar na radiação, por exemplo. Como está na radiação de fundo do Universo. Ou nas ondas de rádio que já lançamos ao espaço. O projeto SETI busca inteligências extra-terrestres a partir da análise das ondas captadas pelos radiotelescópios.