Prof, o moço brigou comigo porque segundo ele eu "respeito" as opiniões, na cabeça dele é ouvir coisas do tipo "ateu é burro porque se apega em uma coisa que ele não tem certeza, igual o teísta", aí eu explico, sem ofender, mas ele vem e diz que por eu explicar eu não estou respeitando sua opinião.

Continue com sua atitude e explique a ele que, pelo contrário, você respeita a opinião dele, mas discorda dela, daí sua argumentação no sentido de que ele a mude.