Ernesto, dois corpos com massas diferentes (m e 2m) percorrem, a partir do repousou, o mesmo descolamento unidimensional sem atrito. Ambos tem energia cinética iguais ou diferentes? Por que não se pode apenas aplicar a eq. Da energia cinética nesse problema?

Não se pode afirmar, pois não se sabe o tempo que cada um levou para fazer o percurso e nem como foi a aceleração ao longo dele. Estou entendendo que a energia cinética que você se refere é a que eles vão ter no fim do percurso. Pela integração da aceleração ao longo do tempo ou do deslocamento (dependendo se ela for informada como uma função do tempo ou da posição na trajetória), acha-se a velocidade final, que, levada na expressão da energia cinética, com a massa de cada um, se acha o valor.