Acha viável um licenciado em física fazer um doutorado direto em matemática aplicada (física-matemática), sendo que essa pessoa ja participou de 4 anos de iniciação científica em supercondutividade? As diciplinas desse doutorado sao puramente matematicas, tais como A.L aplicada,EDP,Analise real.

Pode ser. Mas se sua iniciação científica foi experimental você pode ter alguma dificuldade por não ter feito o bacharelado, em que são vistas matérias mais teóricas, como são as de um doutorado em física-matemática. No bacharelado as disciplinas de mecânica analítica (ou clássica), eletromagnetismo, quântica, física estatística, métodos matemáticos ou algumas optativas puxam bastante por recursos matemáticos mais avançados, o que já facilita.