os naturalistas falham em perceber é que o universo natural, por consequência lógica, não pode dar origem a si mesmo, simplesmente porque se a causa desse universo fosse natural (material), então o que entendemos por universo natural (realidade material e física) já existiria, caindo em contradiço?

Mas o Universo não deu origem a si mesmo, pois isso seria dizer que o Universo já existia. O Universo não se originou de nada (e não "do nada"). Não houve uma criação e sim um surgimento sem ter de que provir. Tudo o que existe de natural (campo, matéria, radiação, espaço, tempo, estruturas e ocorrências) não tem causa, origem e nem propósito.