As "ondas gravitacionais", caso existam, possuem poder de ionização?

Não. Porque elas atuam igualmente sobre todos os corpos. Isso faz parte do "Princípio da Equivalência", que pode ser verificado pelo fato de que todo corpo, independentemente da massa, sofre a mesma aceleração por parte da gravidade. Para haver ionização o campo precisa separar as cargas positivas das negativas, isto é, empurrá-las em sentidos opostos. E a gravidade puxa tudo no mesmo sentido. O que a "onda gravitacional" faria é provocar uma vibração em bloco do corpo todo. Isso é testado em grandes cilindros perfeitamente circulares com sensores que verificam se ocorre alteração periódica na circularidade, com achatamentos e alongamentos.