então um carro se movendo aceleradamente em relação a uma árvore (referencial S), é a mesma coisa que a árvore se movendo aceleradamente em sentido oposto em relação ao carro (considerando em repouso em relação a si mesmo) (referencial S')? Então como saber nesse caso qual é o referencial inercial?

No referencial do carro ele não está acelerado mas há uma força resultante sobre ele. Por outro lado a árvore está acelerada e não há uma força resultante sobre ela. Portanto o referencial do carro não é inercial. No referencial da árvore o carro está acelerado, havendo uma força resultante sobre ele e a árvore não está acelerada, não havendo uma força resultante sobre ela. Portanto o referencial da árvore é inercial.