Prof, eu percebi que os livros do ensino superior são menos didáticos que os dos ensino médio. Além disso, os livros-texto do 3º tem uma ordem de conteúdos não tão bem definida, junta conteúdos e pula outros. É assim mesmo ?

Não. Depende do livro. Há autores que têm boa didática e outros que não. Quanto à ordem, o que você está chamando de "3º"? Seria o terceiro período e você está se referindo aos livros de Cálculo III ou Física III? O que acontece, em geral, é que, em Cálculo III, os capítulos dependem do conteúdo do Cálculo I e do Cálculo II, mas não um do outro. Então diferentes autores escolhem diferentes sequências. No caso da Física III, o assunto é eletricidade e magnetismo, que, normalmente, segue a sequência lógica de encadeamento dos conhecimentos necessários. Na Física II é que a ordem pode ser mudada, pois ela abrange termologia, ondas e ótica. Ótica depende de ondas, mas a termologia pode ser no começo ou no fim. Geralmente é no começo, porque tem mais ligação com a mecânica, que é vista na Física I.